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Dnmt3a CRISPR Activationプラスミド (m) | sc-420035-ACT | 20 µg | $397.00 |
マウスDnmt3aは、新規(de novo)DNAメチル基転移酵素をコードしており、発生および細胞運命の決定過程においてCpGメチル化パターンを確立し、クロマチンのアクセシビリティと長期的な転写プログラムを形成します。DNMT3AはDNMT3BおよびDNMT1と協調してエピジェネティックな記憶を維持し、DNAメチル化をヒストン修飾ネットワークおよび転写抑制と結び付けます。その活性は、分化、ゲノムインプリンティング、トランスポゾンのサイレンシングに影響し、DNMT3A依存的メチル化の破綻は、疾患モデルにおける系譜指定の変化やエピジェネティック不安定性と関連します。したがってDnmt3aは、幹細胞生物学、造血制御、ならびにメチル化依存的な遺伝子発現制御を司る経路において広く研究されています。
Dnmt3a CRISPR活性化プラスミド(m)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性Dnmt3aの発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
Dnmt3a CRISPR 活性化プラスミド (m) は、ヒト細胞株における Dnmt3a 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はDnmt3a転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性Dnmt3aの発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のDnmt3a遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるDnmt3a依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびDnmt3a発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるDnmt3a経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。