C/EBP β CRISPR/Cas9 KOプラスミド (r): sc-437357

概要

CCAAT/エンハンサー結合タンパク質β（C/EBP β、Cebpb）は、ラット細胞において骨髄系分化、脂肪細胞形成、肝細胞の急性期応答を制御する遺伝子プログラムを統括する、ベーシック・ロイシンジッパー（bZIP）型の転写因子である。炎症性および代謝経路からのシグナル（サイトカイン駆動性のJAK/STATやNF-κBのクロストークを含む）を統合し、免疫活性化、ストレス応答、細胞増殖のあり方を形作る転写ネットワークを調節する。C/EBP βの活性はマクロファージの分極や脂質合成関連遺伝子の発現に影響し、慢性炎症、代謝機能障害、組織リモデリングの実験モデルと関連づけられている。そのため、Cebpb依存的な転写の撹乱は、線維化、インスリン抵抗性、炎症シグナル伝達のダイナミクスの基盤機構を探る手段として広く用いられている。

C/EBP β CRISPR/Cas9 KOプラスミド（r）は、rat細胞株における遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、C/EBP βタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、C/EBP βシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• C/EBP βの機能に不可欠なエクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• C/EBP β CRISPR/Cas9 KOプラスミド（r）およびC/EBP β CRISPR/Cas9 KOプラスミド（r2）によってコードされるgRNAは、遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  C/EBP β HDRプラスミド（r）および C/EBP β HDRプラスミド（r2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定の標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。