Not CRISPR data: the image illustrates antibody quality for visualizing CRISPR experiment results.
BAT1/DDX39 Antibody (H-6): sc-271395. Western blot analysis of BAT1/DDX39 expression in untreated K-562 (A), chemically-treated K-562 (B), HCT-116 (C) and HeLa (D) whole cell lysates. β-Actin (C4): sc-47778 used as loading control. Detection reagent used: m-IgG Fc BP-HRP: sc-525409.
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BAT1 CRISPR/Cas9 KO质粒 (h): sc-403785
- 针对种属：human
- 20 µg 纯化的即用型的质粒DNA，最多可供20次转染
- BAT1 CRISPR/Cas9 基因敲除（KO）质粒（h） 是一组质粒混合物，每种质粒均编码 Cas9 核酸酶及针对特定靶点的 20 核苷酸引导 RNA（gRNA），其设计基于 GeCKO v2 文库中的序列，旨在实现最高的基因敲除效率
- gRNA序列引导Cas9在BAT1基因组位点诱导位点特异性双链断裂（DSBs），从而通过非同源末端连接（NHEJ）实现基因敲除
- 嘌呤霉素抗性基因和 RFP 基因两侧有 LoxP 位点，因此在建立稳定的基因敲除细胞系后，可以通过 Cre 重组酶（Cre 向量：sc-418923）去除选择标记。
订购信息
| 产品名称 | 产品编号 | 规格 | 价格 | 数量 | 收藏夹 | |
BAT1 CRISPR/Cas9 KO质粒 (h) | sc-403785 | 20 µg | $397.00 |
概述
DDX39B 编码 BAT1（又称 UAP56），是一种保守的 DEAD-box RNA 解旋酶，可在 ATP 依赖的条件下促进 RNA–蛋白复合物在剪接前体 mRNA（pre-mRNA）剪接及 mRNA 输出过程中的重塑。BAT1 与 TREX/输出相关机器协同作用，将转录、剪接体动态以及核输出相耦联，从而塑造基因表达程序并参与 RNA 质量控制。通过这些功能，DDX39B 的活性会影响细胞增殖、应激反应，以及与 RNA 加工相关的先天免疫信号传导。RNA 解旋酶与 mRNP 生物发生的调控异常常与肿瘤相关的转录状态和炎症表型有关，因此 BAT1 是在疾病相关模型中开展 RNA 代谢机制研究的有用靶点。
BAT1 CRISPR/Cas9 KO质粒（h）是一组旨在针对性地破坏human细胞系中DDX39B基因的质粒池。每条质粒均共表达一种独特的单引导RNA（sgRNA），该sgRNA针对DDX39B基因内的特定位点，并携带来自化脓性链球菌的Cas9核酸酶。这些质粒还编码GFP，可通过荧光显微镜或流式细胞术对成功转染的细胞进行荧光标记和富集。
多引导设计提高了在Cas9介导的双链断裂形成后，产生破坏DDX39B开放阅读框的插入或缺失（indels）的概率。CRISPR/Cas9系统引入的DNA断裂通过内源性非同源末端连接（NHEJ）途径修复，通常会导致移码突变，从而使BAT1蛋白表达失活。
该CRISPR敲除系统能够高效构建DDX39B缺失的细胞模型，用于BAT1信号传导研究、功能基因组学研究、癌症生物学研究以及人类细胞系中治疗反应的评估。
主要特点
- 针对对 BAT1 功能至关重要的 DDX39B 外显子的 sgRNA
通过单质粒共表达 SpCas9 和 sgRNA 以简化递送过程
GFP 报告基因用于识别转染细胞
针对多个 DDX39B 基因组位点的质粒池以提高敲除效率
兼容转染递送
设计变体
CRISPRs +/- HDR
- 由 BAT1 CRISPR/Cas9 KO 质粒 (h) 和 BAT1 CRISPR/Cas9 KO 质粒 (h2) 编码的 gRNA 分别靶向 DDX39B 基因座内的不同位点。可能提供其中一种或两种靶向设计。具体供应情况请参见相关产品。
由 BAT1 HDR 质粒（h）编码的 HDR 供体构建体以及 BAT1 HDR质粒（h2）编码的HDR供体构建体包含一个嘌呤霉素抗性盒和一个RFP报告基因，其两侧由DDX39B同源臂包围，以支持在与CRISPR/Cas9敲除设计对应的特定DDX39B靶位点进行同源导向修复。HDR供体的供应情况可能有所不同。请查看“相关产品”了解供应情况。
仅供研究使用。不用于诊断或治疗。