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BAF170 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-402023-ACT | 20 µg | $397.00 |
SMARCC2 は、ヌクレオソーム配置を調節して転写プログラムを制御する ATP 依存性 SWI/SNF(BAF)クロマチンリモデリング複合体の中核的な足場サブユニットである BAF170 をコードします。BAF170 はエンハンサーおよびプロモーターのアクセス性に寄与し、協調的なクロマチンリモデリングを通じて、系譜決定、細胞周期制御、DNA 損傷応答性の転写に影響を与えます。より広範な BAF/PBAF ネットワークの一部として、SMARCC2 は分化、クロマチン構造、エピジェネティック安定性を司る経路と相互に関わります。SWI/SNF サブユニットの異常はヒト疾患で繰り返し認められており、SMARCC2 の攪乱は、発生関連遺伝子発現の変化や、クロマチン依存的な腫瘍化コンテキストにおける脆弱性と関連づけられています。
BAF170 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性SMARCC2の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
BAF170 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における SMARCC2 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はSMARCC2転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性BAF170の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のSMARCC2遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるBAF170依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびSMARCC2発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるBAF170経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。