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ATR Plasmide di attivazione CRISPR (m) | sc-434115-ACT | 20 µg | $397.00 |
Il gene Atr del topo codifica ATR, una chinasi serina/treonina di tipo PI3K-like che coordina la risposta al danno al DNA durante lo stress replicativo. ATR viene attivata sul DNA a singolo filamento rivestito da RPA e trasmette il segnale tramite effettori come CHK1 per stabilizzare le forcelle di replicazione bloccate, regolare l’attivazione delle origini e imporre i checkpoint intra-S e G2/M. Questa via preserva l’integrità del genoma promuovendo la riparazione del DNA e controllando la progressione del ciclo cellulare, intersecandosi con processi quali la ricombinazione omologa, la protezione della forcella di replicazione e la regolazione dell’apoptosi. Una segnalazione di ATR deregolata è associata a fenotipi di instabilità genomica ed è ampiamente studiata nel contesto della biologia del cancro e dei disturbi dello sviluppo legati a un controllo compromesso dei checkpoint del danno al DNA.
ATR Il plasmide di attivazione CRISPR (m) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di Atr senza alterare la sequenza di DNA sottostante.
ATR Il plasmide di attivazione CRISPR (m) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus Atr nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.
Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione Atr, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di ATR. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus Atr nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da ATR nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via ATR nelle cellule tumorali con espressione di Atr silenziata o ridotta.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.