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Atg16CRISPR激活质粒(h) | sc-404024-ACT | 20 µg | $397.00 |
人类 ATG16L1 基因编码 Atg16,这是 ATG12–ATG5–ATG16L1 复合体的核心组分。该复合体通过在新生吞噬泡(phagophore)上引导 LC3 的脂质化来决定自噬体的形成。Atg16 通过参与宏自噬,支持细胞质质量控制、细胞器更新以及细胞对代谢应激的适应,同时也与先天免疫信号传导和抗微生物反应发生交叉。ATG16L1 活性改变与炎症失调和上皮屏障稳态紊乱有关,而 ATG16L1 的遗传变异与炎症性肠病易感性相关。因此,调控 ATG16L1 的表达有助于在相关的人类细胞模型中研究自噬通量、免疫-代谢串扰以及应激反应表型。
Atg16 CRISPR激活质粒(h)提供了一种靶向、非破坏性的方法,可在不改变底层DNA序列的情况下上调内源性ATG16L1的表达。
Atg16 CRISPR激活质粒(h)是一个由三条质粒组成的协同激活介导(SAM)系统,旨在对人类细胞系中的ATG16L1基因座进行高效、位点特异性的转录上调。该系统以一种携带两个失活突变(D10A 和 N863A)的无催化活性的 Cas9(dCas9)为核心,这些突变消除了核酸酶活性,同时保留了 DNA 结合能力。该 dCas9 与强效转录激活因子 VP64 融合,并与用于筛选的布拉西定抗性基因共同表达。第二个质粒编码MS2-p65-HSF1融合蛋白——这一二级激活复合物与dCas9-VP64协同作用,并携带潮霉素抗性基因。第三个质粒编码靶标特异性20 nt sgRNA,其与两个MS2 RNA适配体融合,这些适配体可将MS2-p65-HSF1复合物招募至激活位点,并携带嘌呤霉素抗性基因。这三个质粒按1:1:1的质量比递送,以确保系统所有组分的平衡表达。
在靶位点组装完成后,SAM复合物结合于ATG16L1转录起始位点上游约200 bp处,VP64、p65和HSF1在此协同作用,招募转录 machinery并驱动内源性Atg16表达上调。与具有核酸酶活性的Cas9不同, dCas9不会引入双链断裂或修改基因组序列,从而保留了原生的ATG16L1位点,并能够研究内源性位点上依赖于Atg16的转录反应,使其成为功能研究、靶基因鉴定以及在ATG16L1表达被沉默或降低的肿瘤细胞中模拟Atg16通路恢复的宝贵工具。
仅供研究使用。不用于诊断或治疗。