Las sustancias químicas que modulan las actividades de FAM83E pueden clasificarse a grandes rasgos en función de las vías a las que se dirigen: PI3K/AKT y MAPK entre ellas. Los inhibidores de PI3K, como LY294002 y Wortmannin, interfieren directamente en la vía PI3K/AKT inhibiendo la cinasa PI3K. El efecto inmediato es una disminución de la fosforilación de AKT, que desempeña un papel decisivo en múltiples actividades celulares en las que está implicado FAM83E. Cabe destacar que NVP-BEZ235 extiende sus efectos inhibidores a mTOR, abarcando así un espectro más amplio de la señalización intracelular que incluye, pero no se limita, a FAM83E.
Los inhibidores de MEK como U0126 y AZD6244, así como los inhibidores de p38 y JNK como SB203580 y SP600125 respectivamente, afectan a la vía MAPK. Estos inhibidores modulan la activación y el funcionamiento de las MAPK, alterando eficazmente las actividades celulares en las que puede influir FAM83E. Los inhibidores de la quinasa Src, como la PP2, se dirigen directamente a las quinasas de la familia Src, implicadas en diversas actividades celulares, como la señalización del crecimiento y la adhesión celular. Al inhibir estas quinasas, la PP2 puede modular vías de señalización que pueden interactuar con las funcionalidades de FAM83E o influir en ellas. En el caso de BAY 43-9006, su capacidad para dirigirse tanto a la quinasa Raf como al VEGFR indica un efecto modulador más complejo sobre el entorno celular en el que actúa FAM83E.