BAP1 Inhibidores

Los inhibidores comunes de BAP1 incluyen, entre otros, el cisplatino CAS 15663-27-1, el peróxido de hidrógeno CAS 7722-84-1, la doxorrubicina CAS 23214-92-8, el etopósido (VP-16) CAS 33419-42-0 y el fluorouracilo CAS 51-21-8.

Los inhibidores de BAP1 son una categoría de agentes químicos que tienen como objetivo la enzima BAP1 (proteína 1 asociada a BRCA1), una enzima desubiquitinante que desempeña un papel crítico en la remodelación de la cromatina, la respuesta al daño del ADN y la regulación del ciclo celular. BAP1 es miembro de la familia de hidrolasas de carboxilo-terminal de ubiquitina (UCH) de enzimas desubiquitinantes y está involucrada en la eliminación de ubiquitina de sustratos proteicos específicos, alterando así su estabilidad, localización y función. La actividad de BAP1 modula varios procesos celulares al regular el estado de ubiquitinación de las histonas y otras proteínas reguladoras clave. Por lo tanto, los inhibidores de BAP1 son pequeñas moléculas u otras entidades químicas que se unen específicamente al sitio activo o a sitios alostéricos de la enzima, impidiendo su actividad desubiquitinante. Al hacerlo, estos inhibidores pueden afectar las vías dependientes de ubiquitina en las que BAP1 es un jugador crítico, influyendo en el paisaje de modificaciones postraduccionales de la célula.

La estructura química de los inhibidores de BAP1 es diversa, reflejando a menudo la complejidad de la especificidad del sustrato de la enzima y los mecanismos matizados por los cuales reconoce y procesa las unidades de ubiquitina. Estos inhibidores típicamente poseen una unidad que imita el estado de transición o el sustrato de BAP1, permitiéndoles unirse con alta afinidad al sitio activo de la enzima. Esta imitación es clave para la especificidad y efectividad del inhibidor en obstruir la actividad enzimática de BAP1. El diseño de tales moléculas toma en cuenta la conformación tridimensional del núcleo catalítico de BAP1, así como la posición de los residuos de aminoácidos clave que participan en el reconocimiento y la hidrólisis de la ubiquitina. Los inhibidores también pueden tener varios grupos funcionales que mejoran su unión a través de interacciones covalentes o no covalentes, como enlaces de hidrógeno, interacciones hidrofóbicas o fuerzas de Van der Waals.