USP11 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-403368

Panoramica

USP11 è una deubiquitinasi umana specifica per l’ubiquitina che rimuove l’ubiquitina dai substrati proteici per regolarne stabilità, localizzazione e output di segnalazione. Attraverso la deubiquitinazione, USP11 contribuisce al controllo della proteostasi e modula vie collegate alle risposte al danno del DNA, alla regolazione trascrizionale e alla progressione del ciclo cellulare. Interazioni riportate collocano USP11 all’interno di reti regolatorie dipendenti dall’ubiquitina che influenzano la segnalazione di stress e processi associati alla cromatina. Un’attività deregolata di USP11 è stata associata ad alterazioni del controllo della crescita cellulare e a fenotipi legati al mantenimento del genoma, a supporto della sua rilevanza nella biologia del cancro e in altri disturbi che coinvolgono uno squilibrio della segnalazione mediata dall’ubiquitina.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO USP11 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene USP11 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del USP11 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto USP11 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina USP11.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di USP11 per lo studio della segnalazione di USP11, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni USP11 critici per la funzione di USP11
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di USP11 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal USP11 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal USP11 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus USP11. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal USP11 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR USP11 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia USP11 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio USP11 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.