UBXN2B CRISPR/Cas9 케이오 플라스미드 (h): sc-407871

개요

UBXN2B(UBX domain protein 2B)는 UBX 계열 어댑터로, 폴리유비퀴틴화된 기질을 AAA+ ATPase인 p97/VCP에 연결해 추출(extraction) 및 이후 프로테아좀 처리로 이어지게 함으로써 유비퀴틴 의존적 단백질 품질 관리에 관여합니다. 이러한 역할을 통해 UBXN2B는 소포체 연관 분해(ER-associated degradation, ERAD) 조절, 잘못 접히거나 손상된 단백질의 제거, 그리고 세포 스트레스 상황에서의 단백질 항상성(proteostasis) 유지에 기여합니다. p97–UBX 보조인자(cofactor) 네트워크의 교란은 세포주기 진행, DNA 손상 반응, 스트레스 신호전달 등 세포 생존성과 분화 프로그램을 형성하는 경로 전반과 폭넓게 연관됩니다. 유비퀴틴–프로테아좀 시스템(ubiquitin–proteasome system, UPS) 회로의 한 노드로서, UBXN2B는 단백질 항상성 불균형과 비정상적인 단백질 제거가 질병 관련 표현형에 기여하는 맥락에서 기전 연구 대상으로 관심을 받고 있습니다.

UBXN2B CRISPR/Cas9 KO 플라스미드 (h)는 human 세포주에서 UBXN2B 유전자의 표적 파괴를 위해 설계된 플라스미드 풀입니다. 각 플라스미드는 UBXN2B 유전자 내의 서로 다른 부위를 표적으로 하는 고유한 단일 가이드 RNA(sgRNA)와 Streptococcus pyogenes Cas9 뉴클레아제를 함께 발현합니다. 또한 이 플라스미드들은 GFP를 암호화하여, 형광 현미경이나 유세포 분석기를 통해 성공적으로 형질전환된 세포를 형광으로 식별하고 농축할 수 있게 합니다.

다중 가이드 설계는 Cas9에 의한 이중 가닥 절단 형성 후 UBXN2B의 개방 독서 틀(ORF)을 파괴하는 삽입 또는 결실(indel)이 발생할 가능성을 높입니다. CRISPR/Cas9 시스템에 의해 유발된 DNA 절단은 내인성 비동종 말단 결합(NHEJ) 경로를 통해 복구되며, 이는 종종 UBXN2B 단백질 발현을 소멸시키는 프레임 시프트 돌연변이를 초래합니다.

이 CRISPR 녹아웃 시스템은 UBXN2B 신호 전달 연구, 기능 유전체학 연구, 암 생물학 연구 및 인간 세포주에서의 치료 반응 평가를 위한 UBXN2B 결핍 세포 모델을 효율적으로 생성할 수 있게 합니다.

주요 특징

• UBXN2B 기능에 중요한 UBXN2B 엑손을 표적하는 sgRNA
  전달을 단순화하기 위해 단일 플라스미드에서 SpCas9 및 sgRNA의 공동 발현
  형질전환된 세포 식별을 위한 GFP 리포터
  녹아웃 효율 향상을 위해 여러 UBXN2B 게놈 부위를 표적하는 플라스미드 풀
  형질전환을 통한 전달과 호환

설계 변형

CRISPRs +/- HDR

• UBXN2B CRISPR/Cas9 KO 플라스미드 (h) 및 UBXN2B CRISPR/Cas9 KO 플라스미드 (h2)에 의해 암호화되는 gRNA는 UBXN2B 유전자좌 내의 서로 다른 부위를 표적화합니다. 표적화 설계 중 하나 또는 둘 다 이용 가능할 수 있습니다. 구입 가능 여부는 관련 제품을 참조하십시오.
  UBXN2B HDR 플라스미드 (h) 및 UBXN2B HDR 플라스미드 (h2)에 의해 암호화되는
  HDR 기증자 컨스트럭트는 푸로마이신 내성 카세트와 RFP 리포터를 포함하며, 이는 CRISPR/Cas9 KO 설계에 해당하는 정의된 UBXN2B 표적 부위에서의 상동성 유도 복구를 지원하기 위해 UBXN2B 상동성 암으로 둘러싸여 있습니다. HDR 기증자의 재고 여부는 달라질 수 있습니다. 재고 여부는 관련 제품을 참조하십시오.

연구용으로만 사용하세요. 진단 또는 치료용이 아닙니다.