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T-cadherinCRISPR激活质粒(h2) | sc-416752-ACT-2 | 20 µg | $397.00 |
人类CDH13基因编码T-钙黏蛋白(cadherin-13),这是一种非典型的糖基磷脂酰肌醇(GPI)锚定型钙黏蛋白,缺乏跨膜结构域和胞质结构域,作为细胞表面黏附与信号调节因子发挥作用。T-钙黏蛋白可影响细胞—细胞相互作用、神经突起生长与突触组织,以及血管/内皮细胞行为,整合多种线索从而调控细胞骨架重塑与接触依赖性的信号通路。CDH13的遗传变异与表达改变已与神经发育和神经精神表型,以及心脏代谢与血管相关性状相关联,提示其在脑连接性与内皮功能障碍研究中具有重要意义。对CDH13进行基因编辑有助于机制性解析由钙黏蛋白介导但不依赖黏附的信号传导,绘制不同变异对蛋白定位与功能的影响,并构建用于通路分析与基因型—表型研究的细胞模型。
T-cadherin CRISPR激活质粒(h2)提供了一种靶向、非破坏性的方法,可在不改变底层DNA序列的情况下上调内源性CDH13的表达。
T-cadherin CRISPR激活质粒(h2)是一个由三条质粒组成的协同激活介导(SAM)系统,旨在对人类细胞系中的CDH13基因座进行高效、位点特异性的转录上调。该系统以一种携带两个失活突变(D10A 和 N863A)的无催化活性的 Cas9(dCas9)为核心,这些突变消除了核酸酶活性,同时保留了 DNA 结合能力。该 dCas9 与强效转录激活因子 VP64 融合,并与用于筛选的布拉西定抗性基因共同表达。第二个质粒编码MS2-p65-HSF1融合蛋白——这一二级激活复合物与dCas9-VP64协同作用,并携带潮霉素抗性基因。第三个质粒编码靶标特异性20 nt sgRNA,其与两个MS2 RNA适配体融合,这些适配体可将MS2-p65-HSF1复合物招募至激活位点,并携带嘌呤霉素抗性基因。这三个质粒按1:1:1的质量比递送,以确保系统所有组分的平衡表达。
在靶位点组装完成后,SAM复合物结合于CDH13转录起始位点上游约200 bp处,VP64、p65和HSF1在此协同作用,招募转录 machinery并驱动内源性T-cadherin表达上调。与具有核酸酶活性的Cas9不同, dCas9不会引入双链断裂或修改基因组序列,从而保留了原生的CDH13位点,并能够研究内源性位点上依赖于T-cadherin的转录反应,使其成为功能研究、靶基因鉴定以及在CDH13表达被沉默或降低的肿瘤细胞中模拟T-cadherin通路恢复的宝贵工具。
仅供研究使用。不用于诊断或治疗。