SUSD2 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-412691

Übersicht

SUSD2 (Sushi-Domäne enthaltend 2) kodiert ein Single-Pass-Transmembranprotein mit extrazellulären Sushi-/CCP-Domänen, die an Zell-Zell- und Zell-Matrix-Interaktionen beteiligt sind. Zu den beschriebenen Funktionen zählen die Modulation von Adhäsions- und Migrationsprogrammen sowie die Regulation immunrelevanter Signalübertragung an der Zelloberfläche, wodurch SUSD2 mit Prozessen wie epithelialer Organisation und dem Crosstalk zwischen Stroma und Tumor in Verbindung gebracht wird. Eine veränderte SUSD2-Expression wurde in mehreren Geweben mit onkogenen Phänotypen assoziiert, darunter Veränderungen der Invasivität und des metastatischen Potenzials. Als oberflächenassoziiertes Scaffold-Protein wird SUSD2 im Kontext von Signalnetzwerken untersucht, die die Wahrnehmung des extrazellulären Mikromilieus und die zelluläre Plastizität beeinflussen.

Das SUSD2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des SUSD2-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des SUSD2-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von SUSD2 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die SUSD2-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von SUSD2-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der SUSD2-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf SUSD2-Exone abzielen, die für die SUSD2-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere SUSD2-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom SUSD2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom SUSD2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des SUSD2-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das SUSD2 HDR-Plasmid (h) und SUSD2 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von SUSD2-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten SUSD2-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.