SRp30c CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-403790

概要

SRSF9は、セリン／アルギニンに富むスプライシング因子SRp30cをコードしており、これはpre-mRNA処理においてスプライス部位の選択やエクソンの定義に寄与するRNA結合タンパク質である。SRp30cは、エクソン性スプライシングエンハンサーや他のSRタンパク質との相互作用を介して、転写産物アイソフォームの産生を形作る選択的スプライシング・プログラムの協調に関与し、RNAプロセシングを転写およびその後のmRNAの運命と連動させる。これらのスプライシングの選択は、細胞周期制御、ストレス応答、分化に関連する遺伝子発現ネットワークに影響を及ぼし得る。SRタンパク質の活性異常やスプライシングパターンの変化は、がんおよび神経変性疾患の生物学に広く関与するとされており、SRSF9はスプライシング駆動型の表現型の機序研究における重要な結節点となる。

SRp30c CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるSRSF9遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、SRSF9内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、SRSF9のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、SRp30cタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、SRp30cシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、SRSF9欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• SRp30cの機能に不可欠なSRSF9エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、SRSF9ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• SRp30c CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびSRp30c CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、SRSF9遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  SRp30c HDRプラスミド（h）および SRp30c HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはSRSF9ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のSRSF9標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。