Sox-13 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-409568

概要

SOX13は、SOXファミリーに属する高移動度群（HMG）ボックス型転写因子であるSox-13をコードしており、DNAに結合して系譜特異的な遺伝子発現プログラムを調節します。Sox-13は、細胞運命の決定や免疫関連遺伝子の発現を形作る転写ネットワークの制御など、発生および分化過程に関与します。ヒト細胞では、SOX13の活性は転写制御やクロマチン依存的な制御を担う経路と関連しており、特定の状況下で免疫調節異常やがん関連の転写状態との関連が報告されています。SOX13の機能を解析することは、SOXファミリー因子が増殖・分化・ストレス応答性の転写に影響する遺伝子制御回路をどのように協調しているのかを明らかにするうえで役立ちます。

Sox-13 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるSOX13遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、SOX13内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、SOX13のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、Sox-13タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、Sox-13シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、SOX13欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• Sox-13の機能に不可欠なSOX13エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、SOX13ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• Sox-13 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびSox-13 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、SOX13遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  Sox-13 HDRプラスミド（h）および Sox-13 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはSOX13ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のSOX13標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。