SETX CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-402354

概要

SETX（senataxin）はDNA/RNAヘリカーゼをコードしており、転写中に生じるRループやその他の核酸二次構造を解消することで、転写伸長とゲノム維持を協調させます。転写共役型DNA損傷応答、複製ストレス制御、RNAプロセシングの接点で機能し、活発に転写されている遺伝子座における二本鎖切断や異常な組換えを抑えるのに寄与します。SETXの活性は、RNAポリメラーゼII、DNA修復因子、停止した転写複合体の監視などに関わる経路と関連しています。SETXの機能異常や変異は神経変性様の表現型やゲノム不安定性症候群と関連しており、転写関連DNA損傷の機序や神経細胞の脆弱性を理解するための研究対象として重要です。

SETX CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるSETX遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、SETX内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、SETXのオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、SETXタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、SETXシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、SETX欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• SETXの機能に不可欠なSETXエクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、SETXゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• SETX CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびSETX CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、SETX遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  SETX HDRプラスミド（h）および SETX HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはSETXホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のSETX標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。