RGPD5 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-401666

概要

RGPD5（RANBP2様／GRIPドメイン含有タンパク質5）は霊長類特異的なRGPD遺伝子ファミリーの一員で、RANBP2/NUP358関連ドメインとの相同性を介して核‐細胞質輸送過程に関与すると考えられています。このファミリーのタンパク質は、Ran GTPアーゼによって制御される輸送、細胞分裂の進行、ならびに核膜でのタンパク質複合体の空間的配置に影響し、その結果として全体的な遺伝子発現プログラムに作用すると推測されています。RGPD5は、2番染色体におけるセグメント重複やコピー数多型との関連でしばしば言及され、これらの特徴がゲノム研究における座位特異的な解釈を難しくしています。がんゲノミクスのデータセットでは、RGPDファミリー領域の発現異常や構造変化が増殖性の表現型やゲノム不安定性との関連で検討されており、核輸送および細胞周期制御の機構研究の標的として用いる根拠が示されています。

RGPD5 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるRGPD5遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、RGPD5内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、RGPD5のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、RGPD5タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、RGPD5シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、RGPD5欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• RGPD5の機能に不可欠なRGPD5エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、RGPD5ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• RGPD5 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびRGPD5 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、RGPD5遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  RGPD5 HDRプラスミド（h）および RGPD5 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはRGPD5ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のRGPD5標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。