Not CRISPR data: the image illustrates antibody quality for visualizing CRISPR experiment results.
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QTRT1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-413456
- 対象生物種: human
- 20 µg のトランスフェクション準備済み、精製したプラスミドDNA、～20回トランスフェクション
- QTRT1 CRISPR/Cas9 ノックアウト（KO）プラスミド（h）は、GeCKO v2ライブラリ由来の配列を用いて最大のノックアウト効率を実現するよう設計された、Cas9ヌクレアーゼおよび標的特異的な20塩基対のガイドRNA（gRNA）をそれぞれコードするプラスミドのプールです
- gRNA配列は、Cas9を誘導してQTRT1ゲノム座において部位特異的な二本鎖切断（DSBs）を引き起こし、非相同末端結合（NHEJ）を介して遺伝子ノックアウトをもたらします
- ピューロマイシン耐性遺伝子とRFP遺伝子はLoxP部位で挟まれているため、安定したノックアウト細胞株を樹立した後、Creリコンビナーゼ（Creベクター：sc-418923）を用いて選択マーカーを除去することができる。
- トランスフェクションの後、遺伝子ノックアウト効果は、抗体を用いたWB、IFまたはIHCによって検定されることができます: QTRT1 抗体 (D-7): sc-398918
注文情報
| 製品名 | カタログ # | 単位 | 価格 | 数量 | お気に入り | |
QTRT1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h) | sc-413456 | 20 µg | $397.00 |
概要
QTRT1は、tRNA-グアニン転移酵素（tRNA-guanine transglycosylase）の触媒サブユニットをコードしており、特定の細胞質tRNAのゆらぎ（wobble）位置におけるケオシン（queuosine）修飾に必須の酵素です。このtRNA編集過程は翻訳の正確性と効率を支え、コドン使用偏りに依存したタンパク質合成、プロテオスタシス、さらに広範なRNA代謝に影響を及ぼします。tRNA修飾の恒常性維持における役割を通じて、QTRT1は栄養状態に依存するケウイン（queuine）のサルベージと、細胞ストレス応答および増殖制御経路を結び付けています。tRNA修飾や翻訳機構の破綻は、ミトコンドリア機能、酸化ストレス感受性、増殖プログラムに関連する表現型と関連付けられており、そのためQTRT1はRNA修飾生物学の機構研究に有用な結節点となります。
QTRT1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるQTRT1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、QTRT1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。
このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、QTRT1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、QTRT1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。
このCRISPRノックアウトシステムにより、QTRT1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、QTRT1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。
主な特徴
- QTRT1の機能に不可欠なQTRT1エクソンを標的とするsgRNA
導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
ノックアウト効率を向上させるための、QTRT1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
トランスフェクションによる導入に対応
設計バリエーション
CRISPRs +/- HDR
- QTRT1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびQTRT1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、QTRT1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
QTRT1 HDRプラスミド（h）および QTRT1 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはQTRT1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のQTRT1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。