PCDH17 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-405740

Übersicht

PCDH17 (Protocadherin-17) ist ein kalziumabhängiges Zell-Zell-Adhäsionsmolekül aus der Protocadherin-Familie, das an der Etablierung und Aufrechterhaltung der Gewebearchitektur beteiligt ist, insbesondere im Nervensystem. Durch die Vermittlung homophiler Interaktionen an der Plasmamembran trägt PCDH17 zum Neuritenauswuchs, zur synaptischen Konnektivität sowie zu Zellsortierungsprozessen bei, die die Schaltkreisbildung prägen. Die mit PCDH17 verbundenen Adhäsionsdynamiken greifen in die Umgestaltung des Zytoskeletts und in Signalwege ein, die Migration und Differenzierung regulieren, einschließlich Rho-Familien-GTPase-gekoppelter Prozesse. Eine dysregulierte PCDH17-Expression oder epigenetische Stilllegung wurde in mehreren Tumorkontexten beschrieben und wird im Hinblick auf veränderte Adhäsion, invasives Verhalten und linienspezifische Transkriptionsprogramme untersucht.

Das PCDH17 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des PCDH17-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des PCDH17-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von PCDH17 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die PCDH17-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von PCDH17-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der PCDH17-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf PCDH17-Exone abzielen, die für die PCDH17-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere PCDH17-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom PCDH17 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom PCDH17 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des PCDH17-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das PCDH17 HDR-Plasmid (h) und PCDH17 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von PCDH17-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten PCDH17-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.