NDR1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-402716

概要

STK38は、セリン／スレオニンキナーゼであるNDR1をコードしており、NDR1はAGCファミリーに属するキナーゼとして、Hippo関連シグナル伝達においてMST1/2の下流で機能し、細胞周期の進行、中心体の生物学、アポトーシス、ならびに細胞骨格の構築を制御する。NDR1の活性はリン酸化や補因子（MOBタンパク質など）との結合によって調節され、上流のストレスや極性のシグナルを転写レベルおよび構造的な出力へと結び付ける。STK38/NDR1は、有糸分裂制御、DNA損傷に関連した応答、上皮恒常性における役割を通じて、腫瘍生物学、神経生物学、炎症関連シグナルに関係する文脈で研究されてきた。NDR1依存性経路の攪乱は、機序解明を目的とした疾患モデルで一般的に評価される増殖・生存・遊走といった表現型に影響を与え得る。

NDR1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるSTK38遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、STK38内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、STK38のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、NDR1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、NDR1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、STK38欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• NDR1の機能に不可欠なSTK38エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、STK38ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• NDR1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびNDR1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、STK38遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  NDR1 HDRプラスミド（h）および NDR1 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはSTK38ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のSTK38標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。