LNX3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-403866

概要

PDZRN3は、PDZドメインを有するRING型E3ユビキチンリガーゼであるLNX3をコードしており、ユビキチン依存的なタンパク質の安定性および輸送（トラフィッキング）の制御に関与すると考えられています。PDZドメインを介した足場（スキャフォールド）相互作用と、RINGドメイン依存的なユビキチン化活性により、LNX3は細胞膜上ならびに細胞接合部や細胞骨格関連コンパートメントにおけるシグナル伝達ネットワークの構築を調節し、細胞極性、接着動態、分化プログラムなどの過程に影響を与える可能性があります。PDZRN3/LNX3は発生パターニングや組織リモデリングに関与する経路とも関連づけられており、ユビキチンシグナルの変化が転写出力や細胞状態の遷移を変動させ得ることが示唆されています。PDZRN3の発現異常やLNX3によるユビキチン化の破綻は、増殖制御の異常や線維化・炎症性リモデリングなどの疾患関連状況で報告されており、シグナル伝達やプロテオスタシスの機構研究における対象として有用であることが支持されています。

LNX3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるPDZRN3遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、PDZRN3内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、PDZRN3のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、LNX3タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、LNX3シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、PDZRN3欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• LNX3の機能に不可欠なPDZRN3エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、PDZRN3ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• LNX3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびLNX3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、PDZRN3遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  LNX3 HDRプラスミド（h）および LNX3 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはPDZRN3ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のPDZRN3標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。