ISGF-3γ p48 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-421156

概要

Irf9はISGF-3γ p48（IRF9としても知られる）をコードしており、これはインターフェロン刺激遺伝子因子3（ISGF3）複合体のDNA結合サブユニットです。IRF9はSTAT1およびSTAT2と協調して、インターフェロン刺激遺伝子（ISG）の転写を促進します。マウス細胞では、IRF9はI型およびIII型インターフェロンシグナル伝達の中核を担い、JAK–STATの活性化を抗ウイルス制限プログラム、抗原提示、さらに広範な自然免疫制御へとつなぎます。ISGネットワークの調節を通じて、IRF9は炎症の基調（炎症トーン）、サイトカイン応答性、ならびに組織内での免疫細胞間コミュニケーションに影響します。IRF9/ISGF3活性の異常は、ウイルス感受性、自己免疫に関連するインターフェロンシグネチャ、そしてがんや代謝性疾患モデルに関わる炎症駆動性の病態といった文脈で、しばしば研究対象となっています。

ISGF-3γ p48 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるIrf9遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Irf9内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Irf9のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、ISGF-3γ p48タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、ISGF-3γ p48シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Irf9欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• ISGF-3γ p48の機能に不可欠なIrf9エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Irf9ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• ISGF-3γ p48 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびISGF-3γ p48 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Irf9遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  ISGF-3γ p48 HDRプラスミド（m）および ISGF-3γ p48 HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはIrf9ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のIrf9標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。