IRX5 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-404838

概要

IRX5は、配列特異的な転写因子であるIroquois homeobox protein 5をコードしており、遺伝子発現プログラムの制御を通じて発生パターン形成や細胞運命決定を調節します。ヒト細胞では、IRX5の活性が発生シグナル伝達経路と交差する転写ネットワークを調節することで、系譜（ライン）決定、組織形態形成、分化状態の維持に寄与します。IRX5発現の異常は、増殖や分化の表現型変化と関連づけられており、腫瘍生物学や発生異常の研究における重要性を示しています。核内調節因子として、IRX5はクロマチン関連の転写制御や下流経路のネットワーク構築への影響という観点から、しばしば解析対象となります。

IRX5 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるIRX5遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、IRX5内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、IRX5のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、IRX5タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、IRX5シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、IRX5欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• IRX5の機能に不可欠なIRX5エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、IRX5ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• IRX5 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびIRX5 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、IRX5遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  IRX5 HDRプラスミド（h）および IRX5 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはIRX5ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のIRX5標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。