IRX4 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-405618

概要

IRX4（Iroquois homeobox 4）は、発生過程における時空間的な遺伝子発現プログラムを制御するホメオドメイン型転写因子をコードしており、心臓をはじめとする中胚葉系譜で重要な役割を担います。核内のDNA結合タンパク質として、IRX4は下流標的遺伝子の発現を調節し、より広範なホメオボックス制御経路と相互作用することで、細胞運命決定、分化、組織パターニングを形作る転写ネットワークに寄与します。IRX4の発現や制御回路の破綻は、がん生物学で観察される発生シグナルの変調や状況依存的な転写状態の変化に関与すると示唆されており、系譜特異化や疾患関連の遺伝子制御を研究する上で重要です。

IRX4 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるIRX4遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、IRX4内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、IRX4のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、IRX4タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、IRX4シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、IRX4欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• IRX4の機能に不可欠なIRX4エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、IRX4ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• IRX4 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびIRX4 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、IRX4遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  IRX4 HDRプラスミド（h）および IRX4 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはIRX4ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のIRX4標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。