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IRE1α Plasmide di attivazione CRISPR (h) | sc-400576-ACT | 20 µg | $397.00 |
ERN1 codifica l’enzima 1 alfa richiedente inositolo (IRE1α), una chinasi/endoribonucleasi transmembrana residente nel RE che funge da sensore centrale del carico di proteine non correttamente ripiegate e avvia la risposta alle proteine mal ripiegate (UPR). In condizioni di stress del RE, IRE1α oligomerizza e attiva la propria attività RNasica per effettuare lo splicing dell’mRNA di XBP1 e promuovere programmi trascrizionali adattativi, attivando al contempo la degradazione regolata dipendente da IRE1 (RIDD) per modulare l’omeostasi degli mRNA. Attraverso il crosstalk con i segnali di PERK e ATF6, ERN1 coordina la proteostasi, il metabolismo lipidico e la segnalazione infiammatoria, influenzando le decisioni sul destino cellulare tra adattamento e apoptosi. Un’attività deregolata dell’asse IRE1α–XBP1 è stata implicata in contesti quali la sopravvivenza delle cellule tumorali sotto stress, la disfunzione metabolica e la neurodegenerazione, rendendo ERN1 un nodo ampiamente utilizzato per studi meccanicistici della biologia dello stress del RE.
IRE1α Il plasmide di attivazione CRISPR (h) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di ERN1 senza alterare la sequenza di DNA sottostante.
IRE1α Il plasmide di attivazione CRISPR (h) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus ERN1 nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.
Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione ERN1, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di IRE1α. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus ERN1 nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da IRE1α nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via IRE1α nelle cellule tumorali con espressione di ERN1 silenziata o ridotta.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.