hnRNP C1/C2 Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (m): sc-420894

Visão geral

Hnrnpc codifica a ribonucleoproteína nuclear heterogênea C1/C2 (hnRNP C1/C2), proteínas nucleares abundantes de ligação a RNA que se associam aos pré-mRNAs para empacotar transcritos recém-sintetizados e determinar o destino do RNA. A hnRNP C participa da escolha co-transcricional de sítios de splicing, do processamento da extremidade 3′ do mRNA e de decisões de retenção/exportação nuclear, além de ajudar a manter a integridade do transcriptoma ao antagonizar a exonização inadequada de elementos Alu e outros eventos crípticos de splicing. Por meio dessas funções, Hnrnpc integra-se às principais vias do metabolismo de RNA e influencia programas de expressão gênica ligados à proliferação, diferenciação e respostas ao estresse celular. A desregulação de hnRNP C tem sido associada na literatura a alterações no panorama de splicing observadas em modelos relevantes para câncer e neurodegeneração, tornando-a um ponto comum para o estudo de defeitos no processamento de RNA.

O Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO hnRNP C1/C2 (m) é um conjunto de plasmídeos concebido para a interrupção direcionada do gene Hnrnpc em linhas celulares mouse. Cada plasmídeo coexpressa um RNA guia único (sgRNA) direcionado a um local distinto dentro do Hnrnpc, juntamente com a nuclease Cas9 de Streptococcus pyogenes. Os plasmídeos também codificam GFP, permitindo a identificação fluorescente e o enriquecimento de células transfectadas com sucesso por microscopia de fluorescência ou citometria de fluxo.

O design multiguia aumenta a probabilidade de gerar inserções ou deleções (indels) que interrompem o quadro de leitura aberto do Hnrnpc na sequência da formação de quebras de cadeia dupla mediadas por Cas9. As quebras de ADN introduzidas pelo sistema CRISPR/Cas9 são reparadas através de vias endógenas de junção de extremidades não homólogas (NHEJ), resultando frequentemente em mutações de deslocamento de quadro que abolir a expressão da proteína hnRNP C1/C2.

Este sistema de knockout CRISPR permite a geração eficiente de modelos celulares com deficiência de Hnrnpc para a investigação da sinalização de hnRNP C1/C2, estudos de genómica funcional, investigação em biologia do cancro e avaliação de respostas terapêuticas em linhas celulares humanas.

Características principais

• sgRNAs direcionados para o(s) exão(ões) Hnrnpc críticos para a função hnRNP C1/C2
  Coexpressão de SpCas9 e sgRNA a partir de um único plasmídeo para simplificar a administração
  Repórter GFP para identificação de células transfectadas
  Conjunto de plasmídeos direcionados para múltiplos locais genómicos Hnrnpc para melhorar a eficiência do knockout
  Compatível com administração por transfecção

Variantes de Design

CRISPRs +/- HDRs

• Os gRNAs codificados pelo hnRNP C1/C2 Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (m) e pelo hnRNP C1/C2 Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (m2) têm como alvo locais distintos dentro do locus Hnrnpc. Pode estar disponível um ou ambos os designs de alvo. Consulte Produtos Relacionados para verificar a disponibilidade.
  As construções doadoras HDR codificadas pelo hnRNP C1/C2 Plasmídeo HDR (m) e o Plasmídeo HDR hnRNP C1/C2 (m2) contêm uma cassete de resistência à puromicina e um repórter RFP flanqueado por braços de homologia Hnrnpc para suportar a reparação dirigida por homologia em locais-alvo Hnrnpc definidos, correspondentes aos desenhos de KO CRISPR/Cas9. A disponibilidade do doador HDR pode variar. Consulte Produtos Relacionados para verificar a disponibilidade.

Apenas para uso em investigação. Não se destina a uso diagnóstico ou terapêutico.