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FAT10 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-402682-ACT | 20 µg | $397.00 |
ヒトのUBDはFAT10をコードしており、FAT10はインターフェロンおよびTNFによって誘導されるユビキチン様修飾因子である。FAT10は、E1/E2/E3様の酵素カスケードを介して基質タンパク質に結合(コンジュゲーション)し、プロテアソーム依存的な迅速な分解を促進する。FAT10は、免疫プロテアソームの制御、抗原処理、炎症性シグナル伝達に関与し、NF-κB活性、細胞ストレス応答、タンパク質品質管理に関連する経路と連携する。UBD/FAT10の発現異常は、慢性炎症やプロテオスタシス(タンパク質恒常性)の破綻と関連づけられており、がんを含む複数の疾患状況で報告されている。がん研究では、細胞周期制御、アポトーシス、ゲノム安定性への影響の観点からしばしば検討される。さらにFAT10は、従来のユビキチン化とは異なるユビキチン様修飾ダイナミクスを研究するための機構的な手がかりも提供する。
FAT10 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性UBDの発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
FAT10 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における UBD 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はUBD転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性FAT10の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のUBD遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるFAT10依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびUBD発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるFAT10経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。