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DNA Ligase I Plasmide di attivazione CRISPR (h) | sc-402830-ACT | 20 µg | $397.00 |
Il gene umano LIG1 codifica la DNA ligasi I, una ligasi ATP-dipendente che sigilla le rotture a singolo filamento e unisce i frammenti di Okazaki durante la replicazione del DNA del filamento ritardato. Questo enzima è un componente fondamentale della replicazione del DNA e di molteplici vie di riparazione del DNA, inclusa la riparazione per escissione di basi e l’elaborazione degli intermedi di riparazione generati durante il mantenimento del genoma. Grazie al coordinamento con PCNA, FEN1 e altri fattori del replisoma e della riparazione, la DNA ligasi I supporta la progressione della forcella replicativa e preserva la stabilità cromosomica. La deregolazione dei processi associati a LIG1 può contribuire a stress replicativo e a fenotipi di instabilità genomica, frequentemente studiati nella biologia del cancro e nella ricerca sulla risposta al danno al DNA.
DNA Ligase I Il plasmide di attivazione CRISPR (h) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di LIG1 senza alterare la sequenza di DNA sottostante.
DNA Ligase I Il plasmide di attivazione CRISPR (h) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus LIG1 nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.
Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione LIG1, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di DNA Ligase I. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus LIG1 nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da DNA Ligase I nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via DNA Ligase I nelle cellule tumorali con espressione di LIG1 silenziata o ridotta.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.