YTHDC2 Inibitori

I comuni inibitori dell'YTHDC2 includono, a titolo esemplificativo, l'ademetionina CAS 29908-03-0, il (R)-4-benzil-2-ossazolidinone CAS 102029-44-7, l'acido meclofenamico CAS 644-62-2, l'RG 108 CAS 48208-26-0 e la 5-azacitidina CAS 320-67-2.

Gli inibitori chimici di YTHDC2 sono caratterizzati dalla capacità di modulare lo stato di metilazione dell'RNA, che è fondamentale per il corretto funzionamento di YTHDC2. YTHDC2 riconosce e si lega specificamente agli RNA modificati con m^6A, influenzando così il metabolismo dell'RNA. Le sostanze chimiche che alterano la metilazione possono avere un impatto sul paesaggio globale della metilazione all'interno della cellula, che a sua volta può influenzare l'attività di YTHDC2. Questa modulazione può avvenire attraverso diversi meccanismi, come la donazione o l'inibizione dei gruppi metilici, l'inibizione degli enzimi che aggiungono o rimuovono i gruppi metilici o la manipolazione dell'espressione genica relativa a queste vie.

I composti elencati servono a donare gruppi metilici necessari per il processo di metilazione, come la S-Adenosilmetionina, o a inibire gli enzimi coinvolti in questi processi, come l'inibizione della S-Adenosil-omocisteina idrolasi da parte della 3-Deazaadenosina. Altri, come l'acido meclofenamico, hanno come bersaglio demetilasi come FTO, che altrimenti diminuirebbero i livelli di m^6A, e quindi hanno un'influenza indiretta sull'affinità di legame dell'RNA di YTHDC2. Inoltre, gli analoghi nucleosidici chimicamente modificati, come la 5-azacitidina e la decitabina, possono essere incorporati nelle molecole di RNA e alterare i normali schemi di metilazione, ostacolando la capacità di YTHDC2 di riconoscere e legare i suoi bersagli di RNA. La nitrofurantoina e altri agenti che modificano gli acidi nucleici possono alterare la struttura dell'RNA, influenzando il riconoscimento e il legame di YTHDC2. Agenti come l'acido retinoico possono indurre cambiamenti nell'espressione genica, compresi i geni che codificano per YTHDC2 o il macchinario enzimatico responsabile della metilazione dell'RNA. Sostanze chimiche come la cicloleucina e la SAH inibiscono le reazioni delle metiltransferasi, il che potrebbe portare a una diminuzione delle modifiche m^6A dell'RNA, con un impatto sull'interazione di YTHDC2 con l'RNA.