VRK3阻害剤と呼ばれる化学物質には、VRK3キナーゼ活性に関連する細胞機構や経路を間接的に標的とする様々な化合物が含まれる。これらの化学物質は主にキナーゼ阻害剤であり、その特異性や選択性は様々である。例えば、スタウロスポリンはよく知られたキナーゼ阻害剤で、触媒キナーゼドメインへの結合をATPと競合させることにより、広範なキナーゼの活性を抑制する。このメカニズムによりVRK3のキナーゼ活性が阻害される。同様に、5-ヨードツベルシジンとK252aはキナーゼのATP結合部位に作用し、競合阻害によるVRK3の活性低下をもたらす可能性がある。
SP600125、H-89、BI-D1870のようなこのクラスの他の化学物質は、それぞれJNK、PKA、RSKのようなキナーゼを特異的に標的とする。これらのキナーゼの活性を調節することで、VRK3に間接的な影響を及ぼし、VRK3の機能を変化させる可能性がある。MAPキナーゼ経路への作用で知られるSB203580とU0126も、セリン/スレオニンキナーゼシグナル伝達の複雑なネットワークを調節することにより、VRK3に影響を与える可能性がある。RO-3306やPalbociclibのような細胞周期の主要な制御因子を標的とした阻害剤も、VRK3の機能に影響を与える可能性がある。VRK3は細胞周期の制御に関与しているので、これらの阻害剤は細胞周期の全体的な制御環境に影響を与えることによって、キナーゼの活性を変化させる可能性がある。WortmanninとPF-4708671は、それぞれPI3K経路とp70 S6キナーゼを標的としており、どちらも細胞内でのVRK3の役割と交差しうる重要なシグナル伝達経路に関与している。
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