Os inibidores químicos da UNQ830 podem interferir com o papel da proteína na ordenação e no tráfico endossómico, visando várias fases da via de transporte vesicular. A bafilomicina A1 inibe as V-ATPases, cruciais para a acidificação vesicular, que é uma condição necessária para o funcionamento correto da UNQ830 na via endocítica. Do mesmo modo, a amantadina perturba o tráfico endossómico alterando o pH, o que, mais uma vez, afecta a capacidade do UNQ830 para participar em processos de triagem dependentes da acidificação. A monensina, como ionóforo carboxílico, também altera os gradientes de pH e perturba o transporte intracelular, inibindo ainda mais a função da UNQ830 no tráfico vesicular.
Por outro lado, compostos como o Dynasore e o MiTMAB têm como alvo direto a atividade GTPase da dinamina, um componente crítico na cisão das vesículas revestidas de clatrina da membrana, impedindo assim o envolvimento do UNQ830 no processo endocítico. A clorpromazina e o Pitstop 2 obstruem a endocitose mediada pela clatrina em diferentes pontos, com a clorpromazina a perturbar a montagem das cavidades revestidas de clatrina e o Pitstop 2 a bloquear a interação do domínio terminal da clatrina com as proteínas acessórias. Esta perturbação da via mediada pela clatrina impediria a função do UNQ830 no tráfico vesicular. A inibição das tirosina-quinases pela genisteína pode afetar a dinâmica das vesículas endocíticas, o que também afectaria o papel do UNQ830 no tráfico. A Ikarugamicina, ao perturbar a endocitose independente da clatrina, e a Filipina III, ao ligar-se ao colesterol e perturbar os domínios da jangada lipídica, podem inibir as vias que o UNQ830 pode utilizar para as suas funções de transporte. Por último, a nistatina perturba os domínios das jangadas lipídicas ao ligar-se ao ergosterol e o EIPA bloqueia a macropinocitose, ambos mecanismos que podem inibir as actividades funcionais do UNQ830.
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