Gli inibitori di TMUB2, secondo le attuali conoscenze, ruotano in gran parte intorno alla modulazione indiretta della proteina attraverso vie di segnalazione interconnesse o correlate. L'approccio principale per colpire TMUB2 indirettamente prevede la manipolazione di queste vie da cui TMUB2 può essere influenzato o associato. Composti come SB203580, SP600125 e U0126, ad esempio, hanno come bersaglio le vie legate alle MAPK. Se TMUB2 ha interazioni con questa via o la sua attività ne è influenzata, questi composti possono fungere da inibitori indiretti. Analogamente, LY294002 e Wortmannin sono inibitori della via PI3K, una via di segnalazione critica nei processi cellulari. Se la funzione di TMUB2 è collegata o dipendente da questa via, questi inibitori possono svolgere un ruolo.
L'azione della rapamicina su mTOR e di composti come BAY 11-7082 e PDTC che agiscono sulla via NF-κB offrono ulteriori possibilità di inibizione indiretta. Se la funzione, la stabilità o le interazioni cellulari di TMUB2 sono influenzate da queste vie, questi composti possono esercitare effetti indiretti su TMUB2. La strategia completa prevede inibitori ad ampio spettro come la staurosporina, che possono influenzare più chinasi e quindi più vie. Se TMUB2 è modulato da una di queste vie o interagisce con esse, questi composti possono agire come inibitori indiretti.
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