A TMEM31, uma proteína transmembranar, tem a sua atividade funcional intrinsecamente ligada a várias vias de sinalização intracelular e a sua ativação é influenciada por uma série de compostos químicos que modulam essas vias. Por exemplo, certos compostos podem aumentar os níveis intracelulares de AMP cíclico (AMPc), quer activando diretamente a adenilil ciclase, quer impedindo a degradação do AMPc, promovendo assim a atividade da TMEM31 através de eventos de fosforilação dependentes da PKA. Além disso, a atividade do TMEM31 pode ser modulada por alterações nos níveis de cálcio intracelular. Os produtos químicos que actuam como ionóforos de cálcio ou que inibem a bomba SERCA elevam o cálcio citosólico, que, por sua vez, pode ativar o TMEM31 através de interacções com proteínas sensíveis ao cálcio, como a calmodulina. Além disso, a modulação da atividade da proteína quinase C, quer através da ativação direta, quer através da inibição dos seus reguladores negativos, pode levar à fosforilação do TMEM31, alterando assim a sua atividade como parte dos processos de transdução de sinal celular.
Além disso, alguns compostos que influenciam o equilíbrio iónico no interior das células, como os inibidores da Na+/K+-ATPase, podem também contribuir indiretamente para a ativação do TMEM31, induzindo alterações que promovem a sinalização através de vias dependentes do cálcio. Outros imitam a ação de moléculas de sinalização endógenas, como os agonistas beta-adrenérgicos que aumentam os níveis de AMPc, ou análogos do AMPc que activam a PKA, facilitando assim a atividade do TMEM31. Além disso, os activadores dos canais de cálcio do tipo L podem instigar uma cascata de eventos intracelulares que, em última análise, aumentam a atividade funcional do TMEM31.
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