TMEM29Bの活性化因子は多様な細胞内メカニズムを通して作用し、それぞれがよく特徴付けられたシグナル伝達カスケードを通してタンパク質の機能状態を変化させるように設計されている。細胞内のサイクリックAMP(cAMP)レベルの上昇は、そのようなメカニズムの基礎の一つであり、アデニルシクラーゼを直接刺激することによって、あるいはGタンパク質共役型受容体に収束するホルモンシグナル経路を介して達成され、最終的にTMEM29Bの活性化につながる。このcAMP依存的な経路は多くの膜貫通タンパク質を制御する古典的な経路であり、TMEM29Bも同様の制御様式であることを示唆している。もう一つの重要な生化学的メカニズムは、細胞内カルシウムレベルの調節である。特異的なカルシウムイオノフォアはカルシウムイオンの流入を促進し、TMEM29Bがそのようなイオンの変化に敏感であれば、活性化につながるような細胞環境を作り出す。このことは、TMEM29Bの機能がカルシウムを介したシグナル伝達と結びついているシナリオにおいて特に重要である。
さらに、ある種の活性化因子は、プロテインキナーゼCに対するアゴニストとして直接的に、あるいは細胞内のキナーゼとホスファターゼ活性のバランスを乱すことによって間接的に、プロテインキナーゼ活性を調節することによって働く。例えば、プロテインホスファターゼの阻害は、多数のタンパク質のリン酸化状態の純増につながり、もしTMEM29Bがこれらの酵素の基質であれば、TMEM29Bもその中に含まれる。このようなリン酸化イベントはタンパク質の活性調節の中心的なものであり、TMEM29Bの活性化において重要なステップであると考えられる。同様に、PI3K/Aktシグナル伝達経路もTMEM29Bの活性化に関与している可能性がある。PI3K/Aktシグナル伝達経路はTMEM29Bの活性化にも関与している可能性があり、この経路を活性化あるいは阻害することで、TMEM29Bを含む下流の標的が変化し、その結果TMEM29Bの活性が変化する可能性がある。
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