TMEM149の化学的阻害剤は、その制御に関与する様々なキナーゼや酵素を標的とすることにより、様々なメカニズムでこのタンパク質の活性に影響を与えることができる。幅広いキナーゼ阻害剤であるスタウロスポリンは、TMEM149の機能に不可欠なリン酸化を阻害することにより、TMEM149の活性を低下させる。Bisindolylmaleimide Iは、プロテインキナーゼC(PKC)を選択的に阻害することにより、TMEM149の活性を低下させることができ、PKCを介したリン酸化がTMEM149の役割にとって重要であることを示唆している。同様に、PKCアイソフォームとPKCβアイソフォームをそれぞれ阻害するGö 6983とLY333531も、TMEM149が依存するPKC依存性のシグナル伝達経路を阻害することにより、TMEM149の活性を抑制することができる。これらの経路を阻害することで、TMEM149の活性化や調節的リン酸化が妨げられると考えられる。
さらに、WortmanninとLY294002は、多くのシグナル伝達経路の上流制御因子であるホスホイノシチド3-キナーゼ(PI3K)を特異的に標的とし、PI3K活性を阻害することにより、これらの阻害剤はTMEM149の機能を低下させることができる。このことは、TMEM149がその活性をPI3Kシグナルに依存している可能性を示唆している。SP600125やAG490のような他の阻害剤は、それぞれJNKやJAK/STATシグナル伝達経路を標的としており、これらもTMEM149の活性を低下させる。この効果は、TMEM149の機能においてこれらの経路が調節的な役割を担っている可能性を示している。さらに、MAPK経路のMEK1/2を阻害するU0126とPD98059は、TMEM149の活性を低下させることができ、MEKを介する経路がTMEM149の制御過程に寄与していることを示唆している。最後に、p38 MAPキナーゼとSrcファミリーチロシンキナーゼをそれぞれ阻害するSB203580とPP2も、TMEM149の活性低下を引き起こすことから、TMEM149の機能調節にこれらのキナーゼが関与していることが示唆される。
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