Os inibidores químicos do TEX261 actuam através de vários mecanismos para impedir a sua função nas vias celulares. A esturosporina, um inibidor da proteína cinase de largo espetro, pode inibir o TEX261 ao impedir a atividade das cinases essenciais para a sua fosforilação, reduzindo assim diretamente a sua atividade. A bisindolilmaleimida I tem como alvo a proteína quinase C (PKC) e, ao inibir a PKC, pode reduzir o estado de fosforilação de TEX261, pressupondo que a PKC ou as vias reguladas pela PKC modulam TEX261. A Wortmannin e o LY294002, ambos inibidores da fosfoinositídeo 3-quinases (PI3K), podem impedir processos dependentes da PI3K vitais para a função do TEX261. Esta ação resulta na inibição direta de TEX261 através da obstrução das vias de sinalização que podem ser cruciais para a sua ativação ou localização.
Além disso, a rapamicina actua sobre a via do alvo mamífero da rapamicina (mTOR). Se a atividade do TEX261 depender da sinalização mediada por mTOR, a sua inibição pela rapamicina conduziria a uma diminuição da função do TEX261. O PD98059 e o U0126, ambos inibidores da MEK, podem inibir o TEX261 bloqueando a via MAPK/ERK, partindo do princípio de que esta via é necessária para os mecanismos reguladores ou a atividade do TEX261. Do mesmo modo, o SP600125 e o SB203580, que têm como alvo a c-Jun N-terminal quinase (JNK) e a p38 MAP quinase, respetivamente, podem diminuir a atividade do TEX261 através da inibição destas vias reguladoras mediadas por quinase. Por último, os inibidores do proteassoma, como o bortezomib, o MG132 e a lactacistina, podem inibir o TEX261 impedindo a degradação proteasomal do próprio TEX261 ou das proteínas que regulam a sua função, o que leva a uma acumulação de inibidores ou à estabilização do TEX261 num estado inativo.
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