Gli inibitori della SPNS3, ciclosporina A e BAPTA-AM, possono modulare la segnalazione legata al calcio. Il probenecid interrompe il trasporto del metabolita, mentre il verapamil influisce sull'attività dei canali del calcio. L'inibizione delle tirosin-chinasi da parte della genisteina e l'antagonismo dei recettori P2X da parte di NF449 possono alterare ampie reti di segnalazione. L'effetto del miconazolo sugli enzimi del citocromo P450 influisce sul metabolismo lipidico e l'inibizione della sfingomielinasi da parte del GW4869 influisce sulla segnalazione degli sfingolipidi. L'inibizione della chinasi della catena leggera della miosina da parte di ML-7 può influenzare le funzioni citoscheletriche e LY294002 interrompe le vie di segnalazione PI3K. PD98059 agisce sulla segnalazione di MAPK e W-7 interrompe i processi dipendenti dalla calmodulina.
Nel complesso, questi agenti dimostrano come diversi inibitori chimici possano influenzare indirettamente l'attività di una proteina, colpendo una varietà di componenti e vie cellulari. L'alterazione di queste vie può modulare la funzione delle proteine associate o regolate da queste vie. La gamma dei bersagli di questi inibitori comprende enzimi, canali ionici, trasportatori e recettori, a testimonianza della miriade di processi che possono essere influenzati per modulare la funzione delle proteine in modo indiretto.
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