Inhibiteurs RNA pol σ 70

Les inhibiteurs courants de l'ARN pol σ 70 comprennent, sans s'y limiter, la streptonigrine CAS 3930-19-6, la fidaxomicine CAS 873857-62-6, la rifaximine CAS 80621-81-4, la roséoflavine CAS 51093-55-1 et le CGP 7930 CAS 57717-80-3.

La classe chimique des inhibiteurs de l'ARN polymérase σ70, bien qu'elle ne cible pas directement la σ70, se concentre sur l'influence de la fonction globale de l'ARN polymérase bactérienne, avec laquelle la σ70 interagit. Les facteurs Sigma tels que la σ70 sont essentiels pour l'initiation de la transcription chez les bactéries, en guidant l'ARN polymérase vers des régions promotrices spécifiques de l'ADN. Les inhibiteurs répertoriés ciblent principalement différentes sous-unités ou domaines fonctionnels de l'ARN polymérase bactérienne. Par exemple, la rifampicine et son dérivé, la rifaximine, se lient à la sous-unité β de l'ARN polymérase, inhibant ainsi la phase d'élongation de la synthèse de l'ARN. Comme la σ70 est impliquée dans la phase d'initiation, l'inhibition de l'élongation de l'ARN polymérase affecte indirectement la fonction de la σ70.

D'autres composés, tels que la streptolydigine et la myxopyronine, ciblent respectivement la sous-unité β' ou la région de commutation de l'ARN polymérase. Ces inhibiteurs peuvent entraver le processus de transcription, ce qui a un impact indirect sur la fonction de σ70 dans l'initiation de la transcription. Des composés comme la sorangicine A et la lipiarmycine ciblent également l'ARN polymérase, ce qui entraîne un effet indirect similaire sur la σ70. La compréhension du rôle de ces inhibiteurs est importante dans le contexte de la recherche antibactérienne et du développement de médicaments. La machinerie de transcription bactérienne, en particulier l'interaction ARN polymérase-σ70, est une cible cruciale pour le développement d'antibiotiques en raison de son rôle central dans l'expression des gènes et la survie bactérienne. Bien que l'impact direct sur la σ70 ne soit pas l'action principale de ces produits chimiques, leur influence sur le complexe de l'ARN polymérase permet de mieux comprendre les mécanismes plus larges de régulation de la transcription bactérienne.