A forskolina, ao aumentar o AMPc, pode ativar a PKA, levando a eventos de fosforilação que podem influenciar uma série de proteínas, incluindo potencialmente as associadas ao RG9MTD3. A ionomicina, ao aumentar os níveis de cálcio intracelular, desencadeia cinases que podem modificar as proteínas que interagem com o RG9MTD3. O galato de epigalocatequina, através da sua ação sobre as metiltransferases do ADN, poderia levar a alterações da expressão genética que afectam as proteínas da rede da RG9MTD3.
O SB216763 e o LY294002 têm como alvo a GSK-3 e a PI3K, respetivamente, enzimas-chave na sinalização celular que podem ter amplos efeitos na estabilidade das proteínas e na sinalização AKT, o que pode afetar a função ou a regulação da RG9MTD3.
A curcumina e o resveratrol estão envolvidos em múltiplas moléculas de sinalização, influenciando potencialmente a regulação da transcrição e a função proteica em vias relevantes para o RG9MTD3. O PD0325901 e a rapamicina, ao alterarem as vias MAPK/ERK e mTOR, respetivamente, podem afetar um conjunto de proteínas reguladoras que se podem cruzar com as que regulam o RG9MTD3. O DAPT, ao inibir a via Notch, pode levar a alterações transcricionais em genes que estão envolvidos nos mesmos processos que o RG9MTD3. O SP600125 e o Wnt-C59, através da inibição das vias de sinalização JNK e Wnt, também podem levar a alterações nas redes de interação de proteínas e vias de sinalização que podem ser cruciais para a regulação ou atividade do RG9MTD3.
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