Gli inibitori di RBM15 hanno come bersaglio i processi di regolazione genica mediati dall'RNA, anche se non inibiscono direttamente RBM15 stesso. L'actinomicina D e l'α-amanitina agiscono interferendo con la trascrizione. La prima si lega al DNA e ostacola il movimento della RNA polimerasi, mentre la seconda inibisce direttamente la RNA polimerasi II. DRB, inibendo la fosforilazione dell'RNA polimerasi II, influisce sull'allungamento della trascrizione, evidenziando il ruolo critico della fosforilazione nel processo di trascrizione.
Nell'ambito dello splicing dell'RNA, il pladienolide B, l'isoginkgetina, la spliceostatina A, l'erbicidiene e la meayamicina B svolgono un ruolo fondamentale. Interferiscono con l'assemblaggio o la funzione dello spliceosoma, che è fondamentale per la maturazione del pre-mRNA in mRNA funzionale. In particolare, diverse di queste sostanze chimiche, come il pladienolide B e la spliceostatina A, hanno come bersaglio il complesso spliceosomiale SF3B o i suoi componenti. Le DNA topoisomerasi, che svolgono un ruolo nella risoluzione dei problemi di superavvolgimento del DNA durante la trascrizione, sono inibite dall'ICRF-193. Questa interferenza può portare a interruzioni della trascrizione. Infine, CX-5461 e BMH-21 colpiscono la RNA polimerasi I, influenzando direttamente la sintesi dell'RNA ribosomiale, evidenziando il loro ruolo nella regolazione del macchinario cellulare per la sintesi proteica.
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