Os inibidores da polinucleótido quinase (PNK) representam uma classe especializada de compostos químicos que visam a atividade enzimática da polinucleótido quinase/fosfatase (PNKP). A PNKP é uma enzima crítica envolvida na reparação do ADN, especificamente no processamento de quebras de cadeia simples e dupla. A enzima possui duas actividades catalíticas distintas: uma atividade cinase que fosforila as extremidades 5'-hidroxil do ADN e uma atividade fosfatase que remove os grupos 3'-fosfato. Estas modificações são essenciais para a ação subsequente das DNA ligases e polimerases no processo de reparação. Ao inibir a atividade cinase ou fosfatase do PNKP, os inibidores do PNK podem modular eficazmente os mecanismos de reparação do ADN, conduzindo a uma acumulação de quebras da cadeia de ADN. A especificidade e a eficiência destes inibidores são cruciais em estudos que visam compreender as vias de reparação do ADN e as respostas celulares aos danos no ADN.
Quimicamente, os inibidores do PNK são concebidos para interagir com os locais activos da enzima PNKP, quer imitando o substrato, quer ligando-se aos locais alostéricos da enzima, alterando assim a sua conformação. Estudos estruturais mostraram que estes inibidores contêm frequentemente grupos funcionais capazes de formar ligações de hidrogénio ou interações iónicas com os resíduos catalíticos do PNKP. O desenvolvimento e o aperfeiçoamento destes inibidores envolvem estudos extensivos da relação estrutura-atividade (SAR) para otimizar a sua afinidade de ligação e seletividade para a PNKP. Estes inibidores são ferramentas valiosas no estudo dos mecanismos de reparação do ADN, fornecendo informações sobre os processos dinâmicos de reconhecimento, sinalização e reparação de danos no ADN. Além disso, são fundamentais para explorar as implicações biológicas mais amplas da atividade do PNKP, tais como o seu papel na estabilidade genómica, no envelhecimento celular e na resposta a factores de stress ambiental.
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