Bei den als PIG-S-Hemmer eingestuften Chemikalien handelt es sich nicht um Inhibitoren im herkömmlichen Sinne, die die enzymatische Aktivität von PIG-S direkt binden und hemmen. Stattdessen beeinflussen diese Verbindungen verschiedene zelluläre Wege und Prozesse, die entweder der eigentlichen enzymatischen Wirkung von PIG-S vor- oder nachgelagert sind oder den zellulären Kontext beeinflussen, in dem PIG-S arbeitet. Die chemische Vielfalt der PIG-S-Inhibitoren ist groß und umfasst Verbindungen, die in erster Linie als Antibiotika, Antiprotozoenmittel und Inhibitoren spezifischer Enzyme in Lipid- und Proteinbiosynthesewegen eingesetzt werden.
Die indirekte Hemmung von PIG-S durch diese Verbindungen beruht auf einer Reihe von Mechanismen. Einige, wie Manumycin A und Fumonisin B1, wirken, indem sie die Biosynthese oder Verarbeitung von Lipiden stören, die für die richtige Lokalisierung oder Funktion von PIG-S in der Zellmembran entscheidend sind. Andere, wie Tunicamycin und Brefeldin A, hemmen wichtige Schritte der Glykosylierung und des Transports von Proteinen, also Prozesse, die für die Reifung von GPI-verankerten Proteinen, zu denen PIG-S beiträgt, wesentlich sind. Verbindungen wie Monensin und Swainsonin stören die intrazellulären Ionengradienten bzw. die Glykanverarbeitung, die beide für den ordnungsgemäßen Transport und die Funktion von GPI-verankerten Proteinen wichtig sind, und beeinflussen damit indirekt die Aktivität von PIG-S. Darüber hinaus kann die Wirkung dieser Verbindungen zu Veränderungen in der zellulären Umgebung führen, die sich auf die Stabilität, die Lokalisierung oder den Umsatz von GPI-verankerten Proteinen auswirken, die die Endprodukte des Biosyntheseweges sind, an dem PIG-S beteiligt ist.
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