Os inibidores químicos da PHF12 podem levar a alterações na regulação da expressão genética, afectando a interação da proteína com a cromatina. Tricostatina A, Mocetinostato, Entinostato, Vorinostato, Romidepsina, Panobinostato, Belinostato, Chidamida, Ácido Valpróico, Butirato de Sódio, Tacedinalina e Pracinostato são compostos que inibem as histonas desacetilases (HDACs), enzimas com as quais se sabe que a PHF12 se associa. A inibição das HDACs resulta no aumento da acetilação das histonas. Este estado hiperacetilado das histonas induzido pelos inibidores pode perturbar a função normal do PHF12 na remodelação da cromatina. Como a acetilação das histonas conduz tipicamente a uma estrutura de cromatina mais aberta, esta alteração pode interferir com a capacidade do PHF12 para modular a cromatina na sua capacidade habitual, afectando o seu papel na regulação da expressão genética.
A ação específica destes inibidores é variável, mas todos convergem para a alteração da paisagem da cromatina através da alteração do padrão de acetilação das histonas. Por exemplo, a Tricostatina A e o Vorinostat são inibidores de HDAC de largo espetro, que afectam uma vasta gama de classes de HDAC, tendo assim um impacto generalizado no estado de acetilação das histonas e das proteínas não-histonas. Em contrapartida, o entinostato inibe seletivamente os HDAC de classe I, o que permite uma alteração mais orientada dos padrões de acetilação relevantes para as actividades do PHF12. Outros compostos, como a romidepsina e o panobinostato, embora também actuem como inibidores de HDAC, podem ter efeitos distintos devido a diferenças na sua estrutura e afinidade por várias enzimas HDAC. Coletivamente, estes inibidores químicos alteram a paisagem de interação do PHF12 com a cromatina, levando a alterações na estrutura e função da cromatina que são mediadas pelo estado de acetilação das histonas.
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