Gli inibitori chimici di PDZK7 servono a modulare la sua attività all'interno di varie vie di segnalazione cellulare. La staurosporina, un inibitore della protein-chinasi ad ampio spettro, può interrompere i processi di fosforilazione essenziali per le interazioni di PDZK7 con altre proteine. Il GW5074, che ha come bersaglio specifico la chinasi c-Raf, può ostacolare PDZK7 ostruendo le vie mediate da c-Raf da cui PDZK7 può dipendere per il suo funzionamento. Inoltre, SP600125, inibendo la c-Jun N-terminal kinase (JNK), può impedire a PDZK7 di impegnarsi nelle vie di segnalazione JNK necessarie per la sua funzione o stabilità nel contesto cellulare.
Ulteriori effetti inibitori su PDZK7 possono essere ottenuti con LY294002 e Wortmannin, entrambi inibitori della fosfoinositide 3-chinasi (PI3K). Mirando a PI3K, questi inibitori possono interferire con le cascate di segnalazione che regolano PDZK7. Analogamente, U0126 e PD98059, in quanto inibitori dell'enzima MEK, possono interrompere la via MEK/ERK, che è probabilmente rilevante per la regolazione del ruolo di PDZK7 nella cellula. SB203580, che ha come bersaglio la p38 MAP chinasi, può influenzare PDZK7 alterando la via p38 MAPK. Inibitori come Lapatinib ed Erlotinib, che hanno come bersaglio EGFR e HER2, possono inibire PDZK7 bloccando le vie di segnalazione che questi recettori controllano e che PDZK7 può utilizzare. Infine, PP2, un inibitore delle chinasi della famiglia Src, e SU5402, un inibitore di FGFR1, possono sopprimere l'attività di PDZK7 ostacolando, rispettivamente, la segnalazione mediata da Src chinasi e FGFR1, in cui PDZK7 può essere coinvolto.
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