OR6M1は、嗅覚伝達経路の重要な構成要素であるこの嗅覚受容体の直接的な機能的関与において極めて重要な役割を果たしている。例えば、シトラールはOR6M1の匂い物質結合部位に結合し、嗅覚ニューロンのシグナル伝達につながる構造変化を起こす。同様に、オイゲノールはOR6M1のリガンド結合ドメインと相互作用し、嗅覚に特異的な細胞応答をもたらすGタンパク質共役受容体シグナル伝達経路を引き起こす。ゲラニオールはOR6M1に結合することで、嗅覚シグナル伝達経路を活性化する構造変化を引き起こす。同様に、(-)-カルボンは受容体の活性部位に結合することでOR6M1を活性化し、嗅覚系内での反応のカスケードを引き起こす。酢酸イソアミルはOR6M1のアゴニストとして作用し、受容体に結合することで、嗅覚受容体に特徴的なGタンパク質シグナル伝達カスケードを開始する。
フェネチルアルコールはOR6M1に関与し、嗅覚シグナル伝達機構の活性化を促進する。一方、ベンズアルデヒドとシンナムアルデヒドはともに、そのリガンド結合ドメインに結合することでOR6M1を直接活性化する。この結合は嗅覚シグナル伝達カスケードの活性化を促す。アネトールもその結合部位と相互作用することでOR6M1を活性化し、嗅覚に関連するシグナル伝達プロセスを開始する。リモネンとヘキサナールは、それぞれ受容体との相互作用を通じてOR6M1を活性化し、Gタンパク質共役型シグナル伝達経路の活性化を促進し、嗅覚シグナル伝達経路を活性化する受容体の構造変化を誘導する。α-ピネンの活性化メカニズムには、OR6M1の活性部位への結合が含まれ、嗅覚系の機能に不可欠な下流のシグナル伝達経路の活性化につながる。これらの化学物質はそれぞれ、OR6M1と直接相互作用することで、受容体の活性化と、それに続く嗅覚情報の伝達を確実にする。
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