OCRL1の化学的阻害剤は、その酵素活性を阻害するために様々なメカニズムを用いる。チロシンキナーゼ阻害剤であるゲニステインは、OCRL1の基質または調節因子であるタンパク質を阻害することでリン酸化過程を標的とし、その機能的活性を低下させる。一方、オルトバナジン酸ナトリウムは、リン酸基を模倣して酵素の活性部位に結合することで、OCRL1の天然の基質と競合する。この競合はOCRL1が通常の脱リン酸化反応を触媒するのを効果的に阻害する。同様に、デオキシノジリマイシンは遷移状態の中間体を構造的に模倣することでOCRL1を拘束し、酵素の糖転移酵素活性を阻害する。フェニルアルシンオキシドは、OCRL1内の近傍のジチオールと重要なシステイン残基に結合することにより、その触媒活性を阻害するという異なるアプローチをとる。
他の阻害剤も、さらに別の細胞メカニズムを通してOCRL1の機能を阻害する。例えば、スラミンはOCRL1の基質結合部位に結合して酵素活性を阻害し、天然の基質との相互作用を妨げる。プロテインホスファターゼの強力な阻害剤であるカリキュリンAは、OCRL1のホスファターゼドメインに結合し、基質の脱リン酸化を阻害する。バフィロマイシンA1は、OCRL1の最適な機能の前提条件であるエンドソームのpHを変化させることにより、間接的にOCRL1の活性を阻害する。ダイナソアは、OCRL1が細胞内の作用部位に到達するために重要な経路であるダイナミン依存性エンドサイトーシスを停止させることにより、OCRL1を阻害する。ティルホスチンAG1478とロスコビチンは間接的に作用する。ティルホスチンAG1478はOCRL1の活性を制御する可能性のあるEGFRチロシンキナーゼを阻害し、ロスコビチンはOCRL1やその基質に影響を及ぼす可能性のあるサイクリン依存性キナーゼを標的とする。最後にクロルプロマジンは、酵素の作用に不可欠な膜結合を変化させることで阻害効果を発揮する。
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