Los inhibidores químicos del MRP-L18 actúan directamente sobre el ribosoma mitocondrial, donde se localiza el MRP-L18 y desempeña un papel fundamental en la síntesis de proteínas. El cloranfenicol logra esta inhibición uniéndose al componente peptidil transferasa del ribosoma mitocondrial, bloqueando así la formación del enlace peptídico que es un paso esencial en la síntesis de nuevas proteínas. Esta acción obstaculiza directamente la función de MRP-L18, ya que no puede contribuir al ensamblaje de proteínas dentro de la mitocondria. Del mismo modo, el Linezolid se une al ribosoma mitocondrial e impide la formación del complejo de iniciación necesario para el comienzo de la síntesis de proteínas, impidiendo directamente la contribución funcional del MRP-L18 a la estructura ribosómica. La tetraciclina y la doxiciclina, ambas unidas a la subunidad 30S del ribosoma mitocondrial, inhiben la unión del aminoacil-ARNt al sitio aceptor ribosomal, que es un requisito previo para la elongación proteica y, por tanto, esencial para la función del MRP-L18 en el ensamblaje proteico.
La Minociclina y la Tigeciclina ejercen su efecto inhibidor sobre el MRP-L18 por un mecanismo similar, en el que su unión al ribosoma mitocondrial obstruye el proceso de síntesis proteica, haciendo que el MRP-L18 no pueda cumplir su función en las operaciones ribosómicas. En el otro lado de la subunidad ribosómica, la Eritromicina, la Azitromicina, la Claritromicina y la Telitromicina se unen de forma irreversible a la subunidad 50S, bloqueando el túnel de salida de la cadena peptídica naciente, acción que interfiere en el correcto funcionamiento del MRP-L18 como parte de la maquinaria ribosómica. La Roxitromicina también se dirige a la subunidad 50S, interrumpiendo la síntesis de proteínas mitocondriales y, en consecuencia, el papel de MRP-L18. Por último, el ácido fusídico impide la acción del factor de elongación G en las mitocondrias, un participante crítico en el paso de translocación de la síntesis de proteínas, inhibiendo así indirectamente la funcionalidad del MRP-L18, que depende del éxito de la elongación y el ensamblaje de proteínas dentro de las mitocondrias.
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