間接的なLRP2BP活性化剤として提示された化学物質の品揃えは、細胞メカニズムや経路の複雑な網の目を示している。例えば、フォルスコリンとIBMXはどちらも、細胞内の基本的な二次メッセンジャーであるcAMPのランドスケープをターゲットにしている。フォルスコリンはcAMPレベルの上昇を促進するが、IBMXはその分解を防ぐことに重点を置いている。このcAMP動態の調節は、LRP2BPに関連する経路を含む、様々な細胞機能におけるcAMPの重要な役割を証明するものである。
キナーゼは、細胞のシグナル伝達マトリックスにおいて極めて重要であることに変わりはない。PMA、PD98059、スタウロスポリンのような化学物質は、この重要性を利用している。PMAはPKC活性化物質として知られているが、スタウロスポリンは幅広いキナーゼ阻害作用を持つ。PD98059は、MAPK/ERK経路に特異的に作用し、この経路は様々な細胞行動を支配する有力なシグナル伝達カスケードである。さらに、カルシウムはユビキタスな細胞内メッセンジャーとして、カルシウム濃度を調節するイオノマイシンやA23187のような薬剤によって操作され、カルシウムを中心としたいくつかの反応を引き起こすことができる。これと並行して、MG-132、トリコスタチンA、ラパマイシンなどの化合物は、タンパク質の分解から遺伝子の発現や成長過程に至るまで、細胞機構のゲートキーパーやモジュレーターとして機能する。
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