O ortovanadato de sódio desempenha um papel crucial na manutenção da fosforilação das proteínas através da inibição das fosfatases, que normalmente invertem esta modificação. A remodelação da cromatina é outra via através da qual a atividade das proteínas é regulada. A 5-Azacitidina e a Tricostatina A, ao inibirem as DNA metiltransferases e as histonas desacetilases, respetivamente, facilitam um estado mais aberto da cromatina, conduzindo à ativação transcricional dos genes. O análogo do AMPc, o Dibutiril AMPc, contorna os receptores celulares e estimula diretamente a proteína quinase A, resultando na fosforilação e ativação de proteínas em várias cascatas de sinalização.
A proteostase é mantida por compostos como o MG132, que inibe o proteasoma, impedindo assim a degradação das proteínas e aumentando potencialmente a sua concentração celular. Do mesmo modo, o 17-AAG perturba a função da Hsp90, uma chaperona envolvida na dobragem e estabilização das proteínas, o que pode resultar na ativação das suas proteínas clientes. As vias de transdução de sinais são intrinsecamente afectadas por moléculas como o LY294002 e o U0126, que são inibidores da PI3K e da MEK, respetivamente. Estes inibidores podem levar à ativação de proteínas a jusante nas vias de sinalização. O SB203580 inibe especificamente a p38 MAPK, que está envolvida na resposta a estímulos de stress e pode afetar o estado de ativação de proteínas reguladas por esta via. A sinalização do cálcio é outra via crítica afetada pelos activadores químicos. A tapsigargina perturba as reservas de cálcio ao inibir a bomba SERCA, conduzindo a um aumento do cálcio citosólico que pode ativar um conjunto de proteínas dependentes do cálcio. A tunicamicina, um inibidor da glicosilação ligada à N, desempenha um papel na dobragem e estabilidade das proteínas, o que pode ter efeitos profundos no estado de ativação das proteínas.
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