Gli inibitori di KLHL21 comprendono una serie di composti chimici che hanno come bersaglio la via dell'ubiquitinazione, fondamentale per il turnover e la regolazione delle proteine. Gli inibitori del proteasoma, come MG-132 e Bortezomib, impediscono la degradazione delle proteine ubiquitinate, con conseguente accumulo dei substrati di KLHL21 e una conseguente inibizione indiretta del ruolo di KLHL21 nel sistema ubiquitina-proteasoma. Analogamente, MLN 4924 (Pevonedistat) agisce sui processi a monte inibendo l'enzima attivatore NEDD8, essenziale per l'attivazione di Cullin 3, un componente centrale del complesso E3 ubiquitina ligasi che coinvolge KLHL21. La curcumina e la clorochina contribuiscono ulteriormente all'inibizione di KLHL21 interrompendo le interazioni proteina-proteina all'interno del complesso E3 ligasi e impedendo la degradazione autofagica delle proteine ubiquitinate, rispettivamente, portando a una diminuzione dell'attività funzionale di KLHL21.
Oltre a questi, composti come talidomide, lenalidomide e pomalidomide inibiscono indirettamente KLHL21 influenzando potenzialmente l'assemblaggio e la funzione dei complessi E3 ubiquitina ligasi attraverso la loro interazione con cereblon, un recettore substrato per una ligasi E3 correlata. Il processo di ubiquitinazione è preso di mira anche da MLN7243, un inibitore dell'enzima E1, insieme a PYR-41, che con lo stesso meccanismo riduce la capacità di KLHL21 di ubiquitinare i substrati. L'auranofina, con il suo impatto sulla regolazione redox, può alterare lo stato funzionale delle proteine all'interno del complesso E3 ligasi, inibendo indirettamente KLHL21. Infine, anche MLN8237 (Alisertib), un inibitore dell'Aurora chinasi A, può attenuare l'attività di KLHL21 modificando lo stato di fosforilazione dei potenziali substrati di KLHL21, evidenziando l'intricata interazione tra fosforilazione e vie di ubiquitinazione nella regolazione della stabilità delle proteine. Nel complesso, questi inibitori di KLHL21 ostacolano il sistema ubiquitina-proteasoma attraverso vari meccanismi, sottolineando la complessa regolazione dei processi di degradazione delle proteine.
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