化学的分類としてのHELB阻害剤は、様々な細胞シグナル伝達経路の調節を通して間接的にHELBタンパク質の機能や活性に影響を与える化合物群を指す。これらの化学物質は、タンパク質やその活性部位に直接結合してHELBを阻害するのではない。その代わりに、HELBが適切に機能するために重要な細胞プロセスやシグナル伝達経路、あるいはHELBが影響を及ぼす生物学的結果に影響を及ぼす。
列挙した化学阻害剤は、ATR、ATM、DNA-PK、Chk1などのDNA損傷応答と修復に関与する主要タンパク質を標的としている。これらのキナーゼを阻害することによって、化学物質はHELBが重要な役割を果たすDNA損傷や複製ストレスに対する細胞応答を組織化するシグナル伝達経路を破壊する。例えば、ATR阻害剤VE-821とETP-46464は、ATRキナーゼを特異的に阻害し、HELB活性を必要とする複製ストレスに対する細胞応答を減弱させる。同様に、KU-55933とCGK733が標的とするATMキナーゼは、HELBのヘリカーゼ活性が関与するプロセスであるDNA二本鎖切断に対する反応に重要である。NU7441やNU7026のようなDNA-PK阻害剤はDNA修復経路、特に非相同末端接合に影響を与えることが知られており、HELBの機能に関与している可能性がある。PF-477736やAZD7762のような化合物によるChk1の阻害は、細胞周期のチェックポイントを混乱させ、DNA複製と修復におけるHELBの役割に影響を与える可能性がある。
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